검사가 공소장을 변경하였다. 이전 공소장에는 “상륙훈련을 진행 중인 군인들을 방해했다”고 만 되어 있었다. 공소장에 따르면 만리포 상륙훈련은 대한민국 해병대 사령부가 한미연합사령부 주관 연합연습 및 훈련계획에 따라 한미연합사령부로부터 위임을 받아 실시했다는 것과 이 훈련에 대한민국 해병대 1사단 3연대 상륙단, 해군 53전대를 포함하여 미군 31MEU 해병 원정부대, 미 해군 11전대가 참가했다는 사실이 확인되었다. 검찰의 공소장 변경은 지난 번 재판에서 공무수행의 쟁점으로 제기된 공무수행의 적법성과 공무수행의 주체에 관한 문제를 의식한 것이다. 검찰 측은 적법한 군사훈련 계획을 방해했다며 관련자들에 대해 특수공무집행방해혐의를 뒤집어 씌웠으나 특수공무집행방해죄가 성립하려면 공무의 적법성이 전제되어야 한다. 그런데 북한의 침략에 대한 방어훈련도 아닌, 평양점령을 목적으로 한 공격연습을, 그것도 해외에 있는 미 해병대와 해군까지 불러들여 진행하는 상륙훈련은 헌법의 평화통일 조항을 무참하게 유린하고 615 남북공동성명, 919 6자회담 공동성명 합의문 등 정치적 합의 및 정부의 공식적인 대북 정책과도 전면으로 배치되는 불법적인 것이다. 따라서 불법적인 상륙훈련에 대한 기자회견 참가자들이 법을 위반한 것이 아니라 불법적인 상륙훈련 계획을 작성한 한미연합사령관과 합참의장을 재판정에 세우라는 것이 이들의 주장이다.